More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0298 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 506 aa  985    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  56.89 
 
 		 501 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  55.25 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  53.07 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  48.03 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  50.89 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  51.09 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  50.89 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  44.38 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  29.67 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.05 
 
 		 573 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.61 
 
 		 558 aa  156  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  26.82 
 
 		 573 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  25.67 
 
 		 559 aa  150  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  25.96 
 
 		 561 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.16 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.83 
 
 		 551 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  27.29 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  24.3 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  24.3 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  26.09 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 557 aa  140  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  26.64 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.43 
 
 		 566 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  25.3 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  28.32 
 
 		 553 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  27.55 
 
 		 550 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  26.98 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  26.32 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  26.76 
 
 		 552 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 564 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  23.7 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  28.5 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  24.06 
 
 		 558 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  23.7 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  24.83 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  24.96 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  23.97 
 
 		 565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  25.26 
 
 		 561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  24.83 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  26.46 
 
 		 567 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  24.02 
 
 		 555 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  28.05 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 557 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  23.37 
 
 		 577 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  25.3 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  24.11 
 
 		 567 aa  127  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  23.92 
 
 		 579 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  22.58 
 
 		 585 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  25.61 
 
 		 561 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  23.05 
 
 		 553 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  22.09 
 
 		 585 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  26.45 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.14 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  24.86 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  23.72 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  24.53 
 
 		 579 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  25.79 
 
 		 561 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  26.14 
 
 		 555 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 579 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  24.66 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  24.96 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  23.78 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  24.22 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  25.57 
 
 		 543 aa  123  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  26.96 
 
 		 565 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  25.09 
 
 		 557 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  24.01 
 
 		 556 aa  123  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  25.18 
 
 		 554 aa  123  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  23.61 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  24.22 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  24.05 
 
 		 579 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  24.05 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.69 
 
 		 580 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  24.22 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  22.99 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  24.02 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  23.96 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  23.93 
 
 		 557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  27.91 
 
 		 532 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  22.7 
 
 		 553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  24.51 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  22.7 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  24.47 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  24.47 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  22.76 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>