More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0745 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  100 
 
 
507 aa  976    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  97.44 
 
 
507 aa  876    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  98.03 
 
 
507 aa  959    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  66.67 
 
 
504 aa  615  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  59.16 
 
 
501 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  54.06 
 
 
507 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  50.49 
 
 
513 aa  443  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  51.09 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  45.88 
 
 
513 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  25.85 
 
 
559 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  27.27 
 
 
551 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  26.13 
 
 
565 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.89 
 
 
551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  25.5 
 
 
554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  24.77 
 
 
554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  26.04 
 
 
555 aa  128  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  25 
 
 
608 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  25.48 
 
 
556 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 
507 aa  127  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  25.56 
 
 
578 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  23.21 
 
 
587 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  24.82 
 
 
593 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  25.45 
 
 
577 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  24.29 
 
 
555 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  24.45 
 
 
554 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  23.91 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  22.99 
 
 
552 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.02 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  26.83 
 
 
550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  22.58 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  24.39 
 
 
559 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  28.27 
 
 
552 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  24.39 
 
 
559 aa  117  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  24.01 
 
 
555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  23.8 
 
 
554 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 
556 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  24.05 
 
 
555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  24.41 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  24.14 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  23.17 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  23.59 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  23.17 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  22.32 
 
 
570 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  29.77 
 
 
502 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  22.98 
 
 
565 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  23.59 
 
 
552 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  23.84 
 
 
557 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  23.41 
 
 
552 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  22.38 
 
 
554 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  27.54 
 
 
532 aa  114  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  25 
 
 
573 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  24.78 
 
 
554 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  23.37 
 
 
560 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  23.32 
 
 
598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  25.63 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  23.12 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  23.66 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  23.6 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  25.69 
 
 
560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  23.48 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  22.2 
 
 
554 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  26.23 
 
 
523 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  23.03 
 
 
552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  23.03 
 
 
552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  26.08 
 
 
529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  23.03 
 
 
552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  23.03 
 
 
552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  23.21 
 
 
580 aa  110  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  22.9 
 
 
559 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  25.99 
 
 
556 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  22.92 
 
 
590 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  25.19 
 
 
543 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  21.34 
 
 
577 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  24.68 
 
 
533 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  23.9 
 
 
554 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  23.22 
 
 
554 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  25.22 
 
 
572 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  23.18 
 
 
591 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  24.37 
 
 
558 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  24.54 
 
 
569 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  23.06 
 
 
567 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  22.6 
 
 
559 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  23.05 
 
 
564 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  22.35 
 
 
574 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  25.98 
 
 
555 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  27.76 
 
 
514 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  23.15 
 
 
580 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  26.65 
 
 
567 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  21.54 
 
 
557 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  23.57 
 
 
562 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  24.21 
 
 
557 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  23.25 
 
 
549 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  22.09 
 
 
553 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  26 
 
 
553 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  27.73 
 
 
557 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.42 
 
 
580 aa  104  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  25.99 
 
 
579 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  22.91 
 
 
559 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  21.96 
 
 
553 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>