More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0651 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 504 aa  975    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  66.53 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  66.53 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  66.47 
 
 		 507 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  59.2 
 
 		 501 aa  535  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  55.25 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  55.05 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  48.03 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  44.77 
 
 		 513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 		 559 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.93 
 
 		 551 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  27.4 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.82 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.59 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  25.66 
 
 		 555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  27.66 
 
 		 578 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  25.55 
 
 		 554 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  24.65 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  24.65 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  25.55 
 
 		 573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  27.96 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  26.37 
 
 		 573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.1 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  29.4 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  27.13 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  26.62 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  26.17 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  26.69 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  25.95 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.48 
 
 		 580 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  25.98 
 
 		 565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  24.95 
 
 		 555 aa  121  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  26.96 
 
 		 523 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  23.89 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  24.21 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  26.45 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  26.84 
 
 		 543 aa  117  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 560 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  22.96 
 
 		 554 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  27.31 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  23.58 
 
 		 571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  25.8 
 
 		 550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  25.18 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  22.96 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  24.73 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  26.55 
 
 		 567 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  22.42 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  25.09 
 
 		 579 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  25.51 
 
 		 558 aa  113  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  24.46 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  25 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  23.61 
 
 		 579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  24.26 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 583 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  24.47 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  24.82 
 
 		 579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 552 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  25.49 
 
 		 579 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  24.87 
 
 		 608 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  24.91 
 
 		 579 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  22.43 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  24.14 
 
 		 577 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  24.91 
 
 		 583 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 559 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 555 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  22.61 
 
 		 555 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  23.4 
 
 		 554 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  24.67 
 
 		 559 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  24.64 
 
 		 557 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  24.87 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  25.32 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  22.65 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  23.76 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  22.69 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  22.55 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  26.65 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  26.41 
 
 		 565 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  23.44 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  24.49 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  24.77 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  21.99 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  21.99 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  24.95 
 
 		 554 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>