More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1983 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1983  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  100 
 
 		 501 aa  972    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207676  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1194  DNA repair protein RecN  61.4 
 
 		 507 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0651  DNA repair protein RecN  59.2 
 
 		 504 aa  531  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291721  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0298  DNA repair protein RecN  56.89 
 
 		 506 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0670  DNA repair protein RecN  58.96 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0745  DNA repair protein RecN  59.16 
 
 		 507 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.674405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1357  DNA repair protein RecN  58.96 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.55184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1084  ATPase  48.11 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.432799  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0658  SMC domain protein  49.9 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00437913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  27.52 
 
 		 551 aa  146  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  25.99 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  27.06 
 
 		 559 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  27.06 
 
 		 559 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  30.13 
 
 		 552 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  24.28 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  25.36 
 
 		 559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.73 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1000  SMC domain-containing protein  30.52 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  23.56 
 
 		 555 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 572 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  27.06 
 
 		 555 aa  134  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  25.77 
 
 		 556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  26.68 
 
 		 554 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  26.71 
 
 		 573 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  27.13 
 
 		 578 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  27.96 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  27.19 
 
 		 529 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  22.98 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  26.27 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  22.58 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  23.08 
 
 		 554 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1509  SMC domain-containing protein  28.16 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.832392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  23.27 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  24.46 
 
 		 570 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  25.87 
 
 		 572 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  26.58 
 
 		 579 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  25.88 
 
 		 579 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  25.35 
 
 		 573 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  23.16 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  25.09 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  26.37 
 
 		 554 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  26.77 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  25.35 
 
 		 579 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  25.49 
 
 		 556 aa  123  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  27.24 
 
 		 552 aa  123  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  25.82 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  25.35 
 
 		 579 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  25.54 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  25.18 
 
 		 583 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  24.09 
 
 		 589 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  25.18 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  26.82 
 
 		 567 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  28.74 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  25.67 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  26.19 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  25 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  25 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  24.95 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  26.19 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  25.4 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  23.27 
 
 		 553 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  25 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  25 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  24.82 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  25.57 
 
 		 557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  24.49 
 
 		 580 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  23.1 
 
 		 554 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  25.31 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  25.43 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  26.45 
 
 		 557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  23.89 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  23.45 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  23.76 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  23.89 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  23.45 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  23.45 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  23.48 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  22.94 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  23.89 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  23.45 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  23.45 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  25.81 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  22.71 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  25.56 
 
 		 579 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  24.14 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  25.4 
 
 		 557 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  23.88 
 
 		 590 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  27.92 
 
 		 553 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  24.74 
 
 		 557 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  24.24 
 
 		 576 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  22.54 
 
 		 553 aa  113  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 557 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  24.65 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  27.81 
 
 		 550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  22.71 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>