More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3391 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3391  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00597312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  58.27 
 
 		 500 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 522 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  43.55 
 
 		 518 aa  98.2  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  46.28 
 
 		 521 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  36.81 
 
 		 523 aa  97.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 		 512 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 510 aa  95.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.35 
 
 		 521 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  33.33 
 
 		 516 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.88 
 
 		 518 aa  71.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  46.24 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  41.58 
 
 		 519 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  33.9 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0403  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 		 559 aa  61.6  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 520 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  34.15 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  39 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  42.7 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1855  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3853  4-phytase  38.79 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  36 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 		 512 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 509 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.77 
 
 		 528 aa  57.8  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  32 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 		 506 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1425  extracellular solute-binding protein family 5  33.85 
 
 		 503 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.19 
 
 		 508 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  44.83 
 
 		 532 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  38.81 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  33.33 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  33.33 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  40.37 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 		 556 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  36 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  38.83 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.74 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.67 
 
 		 532 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4927  extracellular solute-binding protein family 5  35.05 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 575 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2114  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 538 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.59472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  38.81 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1732  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.71 
 
 		 447 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  36.08 
 
 		 496 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5253  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.68 
 
 		 537 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 510 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0900  4-phytase  30.91 
 
 		 533 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0202096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 529 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 575 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 547 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 534 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  33.33 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.1 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 528 aa  54.7  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5254  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.63 
 
 		 537 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.534405  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0979  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 		 530 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  33.96 
 
 		 529 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 527 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  31.37 
 
 		 566 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.37 
 
 		 567 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  32.41 
 
 		 543 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 526 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 525 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1200  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 535 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  42.11 
 
 		 522 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  36.27 
 
 		 539 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 510 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  35.58 
 
 		 532 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 		 544 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.1 
 
 		 559 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.1 
 
 		 555 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 507 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  31.48 
 
 		 529 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 532 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  33.64 
 
 		 631 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  45.1 
 
 		 538 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  35.14 
 
 		 526 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.04 
 
 		 550 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.61 
 
 		 558 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 		 492 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.7 
 
 		 524 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  34.31 
 
 		 523 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.61 
 
 		 558 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 558 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 549 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 		 479 aa  52.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  37.5 
 
 		 545 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 567 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  32.29 
 
 		 596 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>