More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4927 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4927  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 495 aa  983    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  66.32 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1425  extracellular solute-binding protein family 5  62.7 
 
 		 503 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  62.1 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  60.28 
 
 		 502 aa  589  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2741  extracellular solute-binding protein  58.65 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.61 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 522 aa  156  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.95 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.51 
 
 		 545 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  28.68 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.33 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  29.27 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 523 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  30.47 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.06 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.06 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.06 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.06 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  28.44 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.46 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 520 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.18 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  25.73 
 
 		 528 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.26 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.15 
 
 		 505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.58 
 
 		 535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  25.58 
 
 		 495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.23 
 
 		 502 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  28.15 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.97 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.19 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.81 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0239  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.21 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.5 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 526 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 512 aa  106  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  25.4 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.14 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.62 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 595 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 507 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7151  ABC transporter substrate-binding protein  26.92 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  25.4 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.84 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.5 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.84 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.55 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.84 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.84 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 		 514 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>