More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2741 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  67.79 
 
 		 502 aa  682    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2741  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 502 aa  1010    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1425  extracellular solute-binding protein family 5  68.55 
 
 		 503 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  70.43 
 
 		 502 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  62.96 
 
 		 496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4927  extracellular solute-binding protein family 5  58.33 
 
 		 495 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.06 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.9 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 		 525 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.46 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  23.98 
 
 		 527 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.42 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0145  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.24 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1847  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.068039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1894  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.567427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1828  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.73 
 
 		 551 aa  114  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 497 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 523 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  25.16 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  29.66 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.14 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0028  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183012 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 533 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 535 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.59 
 
 		 527 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.17 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.63 
 
 		 516 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  24.41 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5411  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253312  decreased coverage  0.00154474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  25.49 
 
 		 528 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  26.88 
 
 		 533 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  25.11 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5344  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.297716  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  25.32 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 554 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.51 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  23.54 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.59 
 
 		 559 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.51 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.51 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.51 
 
 		 521 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5398  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 523 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  28.1 
 
 		 518 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 497 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.06 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  26.71 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.5 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  29.62 
 
 		 529 aa  98.2  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  25.13 
 
 		 518 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  25.67 
 
 		 495 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 503 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 508 aa  97.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 524 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.69 
 
 		 528 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.36 
 
 		 519 aa  97.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 556 aa  97.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 535 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7272  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.17 
 
 		 528 aa  96.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>