More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3853 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3853  4-phytase  100 
 
 		 528 aa  1039    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  36.71 
 
 		 526 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2999  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 549 aa  326  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  35.5 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  35.2 
 
 		 545 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 		 542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.76 
 
 		 543 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.76 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.76 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.76 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  34.76 
 
 		 543 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  34.54 
 
 		 543 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.54 
 
 		 558 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.54 
 
 		 543 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.54 
 
 		 558 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.54 
 
 		 543 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  34.54 
 
 		 543 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 		 558 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.21 
 
 		 543 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.54 
 
 		 558 aa  292  9e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0865  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 544 aa  289  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  37.42 
 
 		 532 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 		 552 aa  283  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 		 532 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 533 aa  280  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4787  extracellular solute-binding protein family 5  36.8 
 
 		 532 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 		 528 aa  279  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  32.55 
 
 		 556 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  32.11 
 
 		 544 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  32.51 
 
 		 537 aa  276  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  33.2 
 
 		 547 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2885  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 		 528 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128734  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  32.75 
 
 		 556 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  32.86 
 
 		 555 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5343  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220066  normal  0.0289508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  33.47 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 543 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  31.57 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  33.67 
 
 		 537 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  32.99 
 
 		 539 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  31.99 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.99 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 545 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  32.02 
 
 		 554 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  33.27 
 
 		 537 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.91 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  33.53 
 
 		 537 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  33.53 
 
 		 537 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  33.33 
 
 		 537 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  33.27 
 
 		 538 aa  267  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 536 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  33.33 
 
 		 537 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  33.33 
 
 		 537 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2601  extracellular solute-binding protein family 5  32.47 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 558 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  31.52 
 
 		 545 aa  263  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  33.2 
 
 		 529 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.86 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.67 
 
 		 525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.38 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6093  extracellular solute-binding protein family 5  36.09 
 
 		 528 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  31.25 
 
 		 559 aa  256  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 545 aa  256  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  30.52 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2319  extracellular solute-binding protein family 5  32.27 
 
 		 538 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1735  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  30.63 
 
 		 535 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  31.75 
 
 		 538 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 544 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  31.75 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  32.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  32.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  32.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  32.12 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  32.32 
 
 		 535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  32.12 
 
 		 535 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.58 
 
 		 537 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3050  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  30.82 
 
 		 560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>