106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1958 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
177 aa  351  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.28 
 
 
176 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  37.35 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.68 
 
 
178 aa  121  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.47 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  31.18 
 
 
174 aa  117  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.16 
 
 
341 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  30.77 
 
 
275 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.64 
 
 
364 aa  91.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  31.08 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.21 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.83 
 
 
187 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  29.17 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.17 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.54 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  28.31 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  23.78 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 
214 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  23.03 
 
 
177 aa  61.2  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  28 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.56 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.56 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.51 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  28.22 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  24.5 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.02 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 
188 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.97 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  29.63 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.41 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.36 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  25.75 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.93 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.86 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.21 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  27.21 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  25.9 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  23.6 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25.42 
 
 
216 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.82 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
159 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.64 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.97 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  22.64 
 
 
213 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.13 
 
 
175 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.53 
 
 
168 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.03 
 
 
176 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.66 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.82 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  23.42 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.39 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.42 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  24.1 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  24.1 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 
146 aa  44.7  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  26 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.38 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.05 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  25.6 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  25 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  28.38 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.92 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  25 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  23.49 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  23.49 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  23.49 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  22.82 
 
 
176 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.66 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>