104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1082 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
192 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  97.63 
 
 
193 aa  327  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  97.63 
 
 
193 aa  327  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  68.64 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.53 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.94 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.95 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.23 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.99 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  26.99 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.22 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.39 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  30.12 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.49 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.49 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.06 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.17 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.99 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25.88 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.36 
 
 
168 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.14 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  26.21 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  26.03 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  23.18 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.88 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.27 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.95 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  25.81 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.97 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.7 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  22.29 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.64 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.17 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  21.12 
 
 
174 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  25.61 
 
 
166 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  25.61 
 
 
166 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.48 
 
 
176 aa  52  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.9 
 
 
165 aa  51.6  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.72 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.03 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  24.49 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
165 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.46 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  25 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
165 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
165 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 
175 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  22.7 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.28 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  22.7 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.42 
 
 
165 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.83 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  22.7 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  22.7 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  24.7 
 
 
213 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.18 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  22.7 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.8 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  25 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  25 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  23.16 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0826  hypothetical protein  24.22 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.231127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.62 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  22.99 
 
 
275 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.24 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.7 
 
 
168 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 
181 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  27.65 
 
 
167 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.47 
 
 
178 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 
165 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 
165 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 
165 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.86 
 
 
166 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>