104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2843 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.43 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.46 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.91 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  28.47 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  27.33 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.22 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  27.5 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  29.29 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  29.29 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  29.29 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.61 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  27.11 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  27.11 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.63 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.48 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.34 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  26.38 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.36 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.82 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.41 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.36 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  27.59 
 
 
169 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.33 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  21.33 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  23.24 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  26.67 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.24 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.54 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  22.93 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.2 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.24 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  26.06 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.21 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  24.43 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.76 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.88 
 
 
172 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 
197 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.08 
 
 
224 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.24 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1594  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.98 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.79 
 
 
178 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
171 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.44 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  25.61 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  30.57 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  30.57 
 
 
159 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  22.36 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.07 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  28.99 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.64 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.15 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.42 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.55 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.97 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.1 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.9 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.1 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>