21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0476 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.04 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.3 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.18 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.23 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.56 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.25 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.64 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.51 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  28.05 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.68 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  24.68 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.97 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  24.32 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2086  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.09 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>