79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3236 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 174 aa  336  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  71.26 
 
 		 171 aa  250  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  70.11 
 
 		 171 aa  244  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  63.22 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  61.49 
 
 		 173 aa  217  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  56 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  46.86 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  41.42 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.15 
 
 		 212 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.52 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.35 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.68 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.3 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.56 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.56 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.59 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.59 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.53 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  26.53 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.76 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  29.03 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  23.53 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.16 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.07 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0199  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.53 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  25 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.09 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.14 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.88 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.92 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.68 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.17 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.51 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.68 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.51 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.68 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.16 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.01 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  22.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.92 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.45 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.43 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  22.22 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.67 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  23.98 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 		 165 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 		 172 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 175 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  20.67 
 
 		 275 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.26 
 
 		 175 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 		 196 aa  40.8  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.03 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>