18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3187 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 197 aa  383  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1072  OmpH family outer membrane protein  28.19 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0864  hypothetical protein  25.41 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2086  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.29 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1406  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1281  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.29 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.986683  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.23 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2145  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.41 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.26588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2868  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.81 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.07447  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1595  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.7 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.069482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.47 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  23.73 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2452  hypothetical protein  22.76 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.871205  hitchhiker  0.000445198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>