50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1849 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 179 aa  355  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  31.1 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.43 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.19 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  28.83 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.06 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.53 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.22 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.22 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.39 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.39 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  29.14 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.86 
 
 		 168 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.88 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  28.24 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  28.47 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.18 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.08 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  24.39 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  24.39 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1072  OmpH family outer membrane protein  23.86 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.92 
 
 		 195 aa  44.3  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.71 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1595  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  38.98 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  38.98 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  38.98 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.28 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.23 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.47 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25.79 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  38.71 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  38.71 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>