25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2796 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2086  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  43.27 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465467  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2145  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.26588  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.94 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.97 
 
 
183 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  28.29 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.97 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.54 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6204  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.89318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1370  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249097  decreased coverage  0.00550901 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.02 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2868  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.35 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.07447  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.52 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  27.08 
 
 
177 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.52 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  24.11 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.68 
 
 
146 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>