13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2145 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2145  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 215 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.26588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6204  hypothetical protein  73.11 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.89318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1370  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  72.64 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249097  decreased coverage  0.00550901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1500  outer membrane chaperone Skp  44.72 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2452  hypothetical protein  44.58 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.871205  hitchhiker  0.000445198 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.52 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1406  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40 
 
 		 181 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.370194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.76 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.17 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2086  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1595  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>