46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0247 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.49 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.81 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.25 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.4 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.73 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.18 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.89 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  26.35 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.62 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25.85 
 
 		 171 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.83 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.92 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  25 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.33 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  25.27 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  17.45 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.27 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  21.2 
 
 		 168 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.05 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  25 
 
 		 167 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.28 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.53 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.06 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  21.2 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.2 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  22.62 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  24.26 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.5 
 
 		 179 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  19.21 
 
 		 171 aa  41.6  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>