63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1389 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
196 aa  381  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.03 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  24.85 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  28.07 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2086  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
205 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465467  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  26.35 
 
 
164 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  22.97 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  22.09 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1072  OmpH family outer membrane protein  18.72 
 
 
182 aa  48.9  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  25 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  25.44 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  25 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  23.13 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  23.87 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  24.36 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  25.64 
 
 
167 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 
175 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.13 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.3 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1595  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.87 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  20 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  24.7 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.29 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0178  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.6 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.2 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.36 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  24.2 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  24.2 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  24.28 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.3 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  22.6 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2868  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.38 
 
 
245 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.07447  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.19 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 
165 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  24.12 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.73 
 
 
173 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.069482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  20.81 
 
 
166 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  20.81 
 
 
166 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>