99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0572 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
167 aa  329  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.94 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  30.95 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  27.98 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  27.54 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  29.17 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  29.22 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.7 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.25 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.25 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.25 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  29.27 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  29.27 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.27 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1281  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.986683  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.05 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.05 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.34 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 
188 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.07 
 
 
175 aa  53.9  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.03 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  23.17 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2967  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.939427  normal  0.289934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
173 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.38 
 
 
166 aa  51.2  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  24.16 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 
175 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  26.63 
 
 
165 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.62 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  27.65 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  20.42 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  26.27 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  26.27 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  26.27 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
183 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
193 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
193 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.53 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  28.46 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  23.84 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.07 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  23.08 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0199  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.42 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  23.14 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.47 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.15 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  22.41 
 
 
176 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  21.99 
 
 
177 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  24.85 
 
 
165 aa  44.3  0.0009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.88 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.88 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.88 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.13 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.49 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.81 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.13 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.49 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.72 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.61 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  22.81 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  26.45 
 
 
168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.73 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0469  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 
211 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.716788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  23.72 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.52 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.96 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.28 
 
 
175 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>