33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1863 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
162 aa  327  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  79.63 
 
 
164 aa  263  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  49.04 
 
 
163 aa  157  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.59 
 
 
155 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.09 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.5 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.56 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
171 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  25.62 
 
 
168 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 
207 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.58 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.95 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.58 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.35 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.24 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.86 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.43 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.56 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  25.52 
 
 
190 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  21.35 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  26.47 
 
 
213 aa  44.3  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.42 
 
 
230 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.2 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.19 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.28 
 
 
173 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  21.91 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  26.67 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>