62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1359 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 169 aa  333  5.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.05 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  38.69 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.95 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.59 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  31.79 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.14 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  32.02 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05165  hypothetical protein  27.54 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.37 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.54 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  27.81 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  29.14 
 
 		 213 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.73 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  27.15 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.26 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.68 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.38 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.38 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.38 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.38 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  25.61 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  25.32 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  26.21 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.19 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.95 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25.83 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  22.76 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.11 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  24.81 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.99 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  24.81 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  26.37 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  24.81 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.09 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.16 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.12 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.83 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  23.26 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  23.02 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.03 
 
 		 196 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  23.02 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  27.97 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  26.38 
 
 		 275 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  27.97 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.03 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.21 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  27.54 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.53 
 
 		 341 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.59 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 		 165 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 172 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.2 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>