32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08486 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  28.9 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  30.52 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  28.57 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.71 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.71 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.21 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  25.3 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.38 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.67 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.41 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  30.23 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  24.72 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.64 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.21 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  23.84 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.35 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.95 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 		 184 aa  42  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>