109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1453 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.32 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.3 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.82 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  30.86 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.32 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  29.63 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.63 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.88 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.99 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.23 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.11 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.87 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.68 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.43 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.1 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  31.43 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.33 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  30.41 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  26.95 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.17 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.8 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25.47 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  29.45 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.88 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.99 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  30.41 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  28.12 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.22 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.15 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.27 
 
 
224 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
167 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  26.57 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  26.57 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.57 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.55 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.86 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.3 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.65 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.62 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
221 aa  58.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.7 
 
 
170 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.62 
 
 
341 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  25.14 
 
 
275 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.44 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
171 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 
176 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.84 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.97 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.14 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.14 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.47 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.66 
 
 
221 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.18 
 
 
214 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  25.6 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 
364 aa  50.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  16.77 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  24.05 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.35 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 
165 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 
165 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 
165 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.4 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.64 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  24.26 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  27.95 
 
 
169 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.94 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  26.21 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.21 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.78 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  24.8 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  23.08 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  23.08 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>