93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3413 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.9 
 
 		 190 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.9 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.78 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.88 
 
 		 176 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.67 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  34.09 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.23 
 
 		 341 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  33.14 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.67 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  30.12 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.53 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.07 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.22 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  26.32 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.3 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.12 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  26.04 
 
 		 167 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.6 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.38 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.76 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.74 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.71 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  29.47 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  28.48 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  25.16 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.85 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  32.47 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.87 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.31 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.56 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.73 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  29.24 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.32 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.75 
 
 		 169 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.73 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  26.49 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.82 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.82 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.28 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  27.68 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.26 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.52 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  25.85 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.68 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.68 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  26.32 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  26.01 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  24.49 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  24.49 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.49 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.35 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.22 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.18 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.05 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  24.72 
 
 		 169 aa  42  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.35 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1084  hypothetical protein  28.07 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.640255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>