26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3263 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.65 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.68 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.14 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  32.3 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.86 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  27.21 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  29.17 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.31 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  23.36 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.1 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 		 211 aa  50.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25.35 
 
 		 216 aa  50.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.95 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  22.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.31 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  24.05 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  23.89 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.06 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.53 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>