51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4436 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  51.18 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  37.89 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  35.98 
 
 		 216 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  31.98 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.02 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.05 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  30.38 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 		 169 aa  72  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.44 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.3 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.57 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.81 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.91 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  29.52 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.45 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  26.56 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.14 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  23.44 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.44 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.46 
 
 		 171 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  26.42 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  30.2 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  25.26 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.15 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  27.61 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.67 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 165 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.23 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  23.6 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  23.45 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.23 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  26.62 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.46 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.06 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.22 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.34 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.72 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.97 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.48 
 
 		 156 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0780  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.59 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230536  normal  0.263153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  22.52 
 
 		 171 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  22.88 
 
 		 166 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  22.88 
 
 		 166 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>