114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01382 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  100 
 
 
171 aa  339  9e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  59.17 
 
 
171 aa  191  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  41.76 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.49 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  35.8 
 
 
165 aa  121  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.86 
 
 
165 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  41.89 
 
 
176 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  39.63 
 
 
165 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.26 
 
 
165 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.99 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  40.69 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  40.69 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  40.69 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.56 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  40.24 
 
 
164 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.04 
 
 
165 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.42 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.42 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.42 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.42 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.94 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  39.72 
 
 
168 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.72 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.72 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.72 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.11 
 
 
164 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  37.28 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  40 
 
 
165 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  39.31 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  34.52 
 
 
169 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  33.14 
 
 
171 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  32.53 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  32.03 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00176  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000232591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3425  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0180  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.80617e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0182  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000231614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00175  hypothetical protein  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000443159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3482  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000160675  normal  0.0663519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0189  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000067294  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0171  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0188  periplasmic chaperone  34.46 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000198336  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  31.95 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  31.95 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.59 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2967  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.25 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.939427  normal  0.289934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.49 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.73 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  24.22 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.55 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  26.71 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  26.71 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 
166 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.42 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
169 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.59 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.21 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.09 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  26.74 
 
 
168 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.24 
 
 
176 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.68 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.68 
 
 
221 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.22 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  26.44 
 
 
167 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  26.16 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  23.75 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.62 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  30.23 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.42 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  25.95 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.23 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0405  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.68 
 
 
211 aa  47.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.490313  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 
175 aa  47.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  25.32 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.97 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  24.83 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.42 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20 
 
 
183 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  25.32 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.29 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  27.15 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.16 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  19.57 
 
 
177 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.43 
 
 
182 aa  42  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>