28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3973 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  60 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  43.87 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  31.8 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.67 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0535  hypothetical protein  27.37 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  31.08 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.85 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.92 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.09 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.47 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  23.57 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.44 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  23.57 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  26.95 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.9 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.62 
 
 		 603 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.24 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.19 
 
 		 221 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.68 
 
 		 171 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.55 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.76 
 
 		 167 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.85 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>