13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3467 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.8 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_002950  PG0535  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.92 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.3 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  29.08 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.81 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.12 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.41 
 
 		 193 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.41 
 
 		 193 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>