13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1713 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.88 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.33 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.69 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_002950  PG0535  hypothetical protein  26.8 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  27.05 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 164 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.43 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>