28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1862 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  79.63 
 
 		 162 aa  263  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  49.64 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.58 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.97 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.27 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.52 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.43 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.19 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.54 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.37 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  27.68 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.12 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.42 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  26.74 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.57 
 
 		 196 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  27.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  27.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.5 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.92 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.69 
 
 		 216 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  23.13 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.28 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  23.6 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>