33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1698 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
159 aa  313  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  93.08 
 
 
159 aa  277  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.13 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0839  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.97 
 
 
161 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0089  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 
144 aa  79  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.95 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  20.73 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.34 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  25.29 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.54 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.54 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0405  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.66 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.490313  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  24.55 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  25.15 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.81 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.16 
 
 
165 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  20 
 
 
171 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  21.47 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.47 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>