21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0839 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0839  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 161 aa  319  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0089  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.14 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.61 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.97 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.46 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0817  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.98 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.821824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  22.82 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.16 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.36 
 
 		 176 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  24.32 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 		 192 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  24.42 
 
 		 181 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.89 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.89 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0321  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  28.87 
 
 		 878 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.1 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>