97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0381 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  54.7 
 
 
196 aa  204  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.86 
 
 
185 aa  167  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  42.86 
 
 
196 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.51 
 
 
182 aa  147  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.16 
 
 
187 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  44.58 
 
 
181 aa  140  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  23.84 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  28.3 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.45 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  30.18 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.67 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  21.26 
 
 
275 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 
221 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  25.33 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  25.33 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  25.33 
 
 
165 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  29.2 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 
341 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.54 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 
165 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  28.57 
 
 
168 aa  55.1  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  29.29 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.03 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.78 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.66 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.38 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
169 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  24.84 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.43 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  31.21 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.82 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  22.37 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  29.19 
 
 
216 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.18 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.12 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  26.54 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  26.54 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000300705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.4 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.73 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17670  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.61 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  25.32 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.5 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00175  hypothetical protein  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000443159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3425  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000142566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00176  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000232591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0188  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000198336  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.16 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0171  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0180  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.80617e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0189  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000067294  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3482  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000160675  normal  0.0663519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0182  periplasmic chaperone  26.49 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000231614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2588  hypothetical protein  31.82 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.92104  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  20.69 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  17.86 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  24.03 
 
 
165 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  17.86 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  23.6 
 
 
177 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.16 
 
 
165 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0826  hypothetical protein  25.32 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.231127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
139 aa  41.2  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>