21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17670 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17670  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.5 
 
 
152 aa  52  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17650  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.34 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.29 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 
164 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.53 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.53 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.53 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  31.45 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.3 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.3 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.3 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.41 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.3 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.44 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.55 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.14 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.97 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>