20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17650 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17650  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17670  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.34 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 
175 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 
175 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.69 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.69 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.69 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.69 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.45 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  23.45 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  23.45 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.45 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.96 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>