11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0682 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
146 aa  293  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17670  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.52 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.99 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
184 aa  48.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.54 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25.76 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17650  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.69 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.68 
 
 
209 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.48 
 
 
155 aa  40  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>