12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1291 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 155 aa  310  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  55.41 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.58 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.59 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0715  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.48 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0716  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.239683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.85 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  28.97 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  30.34 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17670  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.97 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  26.83 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>