79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1054 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 169 aa  336  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.65 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.48 
 
 		 186 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  38.24 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.93 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.95 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.02 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  28.4 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  32.19 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  29.65 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.64 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.13 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  26.49 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  28.09 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  30.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.99 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.82 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.17 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.67 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25.73 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.36 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  25.15 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.79 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.29 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.32 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.14 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.43 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.2 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  25.68 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.58 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  28.67 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.67 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.44 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  26.09 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  24.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  24.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  24.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.48 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.31 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.31 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.45 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  23.4 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.61 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.57 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  23.48 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.69 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1291  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.46 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.171766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.7 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.69 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.6 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 		 178 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 		 175 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.89 
 
 		 156 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  19.69 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  23.49 
 
 		 275 aa  41.2  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  24.39 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>