30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04305 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.83 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.69 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.24 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.76 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05165  hypothetical protein  29.19 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.3 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.75 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  30.61 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.36 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  27.01 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  26.8 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  25.3 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  24.34 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.98 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.57 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.35 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.34 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  24.03 
 
 		 275 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.43 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.82 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 		 341 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  21.05 
 
 		 213 aa  41.6  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  24.72 
 
 		 206 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.77 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  26.23 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>