102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0410 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  60.11 
 
 
185 aa  228  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  61.88 
 
 
181 aa  222  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  57.69 
 
 
187 aa  201  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  50 
 
 
196 aa  181  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.67 
 
 
196 aa  150  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.51 
 
 
184 aa  147  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.21 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  26.11 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.13 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.12 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.91 
 
 
167 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.14 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  23.56 
 
 
275 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.57 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.09 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  23.53 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.1 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.15 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.15 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.11 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.89 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  27.89 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.63 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.28 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  27.22 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  27.81 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.33 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.25 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  25.57 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.19 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.19 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.3 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.3 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.3 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.3 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  24.86 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.44 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  25.29 
 
 
165 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  25.29 
 
 
165 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  25.29 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.13 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.16 
 
 
168 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  23.13 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  23.13 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.13 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.68 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.52 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  28.04 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
171 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.07 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  24.7 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  26.16 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  29.19 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  27.51 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1155  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.35 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.35 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.71 
 
 
177 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.22 
 
 
341 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  24.43 
 
 
171 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.71 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  24.16 
 
 
184 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.11 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.99 
 
 
160 aa  41.6  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  31.45 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  28.74 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  28.35 
 
 
159 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  26.06 
 
 
171 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  24 
 
 
190 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>