46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03345 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.64 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.36 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.11 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3211  hypothetical protein  30.89 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00229754  normal  0.155539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.08 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  23.53 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.83 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.14 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  24.85 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  24.53 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  24.55 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  27.7 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.7 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1713  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  28.18 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  31.18 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  21.12 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  21.12 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  26.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  26.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  26.36 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.64 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.18 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.56 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  28.24 
 
 		 213 aa  47.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5660  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.41 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.82 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.84 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.61 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.26 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.61 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.53 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.39 
 
 		 188 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  24.07 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.95 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.67 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.17 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.77 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.63 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>