30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0834 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 170 aa  341  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  39.64 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1000  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.88 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.85 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3211  hypothetical protein  25.5 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00229754  normal  0.155539 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.14 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.86 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0599  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.95 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  27.21 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.3 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.53 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.13 
 
 		 230 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  23.16 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.29 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0089  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.77 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2796  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.465762  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.21 
 
 		 171 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  26.47 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.54 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>