67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0595 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0595  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 160 aa  318  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1755  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.48 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1698  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.13 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0839  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.46 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0089  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.42 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.84 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.84 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.69 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.95 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.01 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.98 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.56 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.08 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.15 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.83 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.89 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.57 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.48 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  22.38 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.36 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  21.56 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3973  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.73 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.297953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.56 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.63 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1290  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.382466  normal  0.245973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  25.61 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.12 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  22.54 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2335  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.86 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737596 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  23.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  23.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  23.57 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.02 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  23.49 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  23.78 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.9 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.72 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.6 
 
 		 173 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  24.48 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.6 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.99 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  20.25 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.85 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  27.54 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  21.69 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.76 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>