10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1787 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  100 
 
 		 170 aa  351  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1594  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  39.29 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0178  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.96 
 
 		 169 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2078  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 201 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0364  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.97 
 
 		 294 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0430912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.43 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.74 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  21.89 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.497381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>