17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1594 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1594  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0178  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  68.61 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1787  putative lipoprotein  41.4 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000149194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2078  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  45.99 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.72 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.1 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.45 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.77 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2509  putative outer membrane protein  27.89 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.32 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  28.19 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  24.53 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  29.17 
 
 		 177 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_002620  TC0513  cationic outer membrane protein OmpH, putative  23.18 
 
 		 173 aa  42  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0122561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>