106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2230 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  53.22 
 
 
171 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.1 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.71 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.14 
 
 
188 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.41 
 
 
175 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  31.97 
 
 
177 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
175 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  32.37 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.49 
 
 
175 aa  94.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.52 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.07 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.07 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.54 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.37 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  28.48 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.24 
 
 
224 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.14 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  29.34 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.51 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.06 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.85 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.59 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.32 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.57 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.85 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.83 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 
213 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.79 
 
 
187 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1594  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.15 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  21.33 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  25.45 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.33 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.16 
 
 
166 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  23.67 
 
 
168 aa  52  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 
341 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.67 
 
 
174 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.67 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.88 
 
 
223 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2967  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.55 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.939427  normal  0.289934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.7 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.38 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
175 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.17 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  21.09 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.38 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.71 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  23.64 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.45 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.56 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  28.28 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.41 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
177 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0178  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 
169 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  20.51 
 
 
172 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  19.66 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
177 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  21.83 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  21.83 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  21.83 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.67 
 
 
177 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  23.84 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  23.78 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.46 
 
 
221 aa  45.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.43 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  21.43 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  21.43 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 
167 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.83 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  16.33 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  16.33 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.47 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  17.75 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.08 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.11 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.86 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.28 
 
 
175 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.63 
 
 
164 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>