22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4026 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  47.03 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.5 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.38 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.36 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.41 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.63 
 
 		 172 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.55 
 
 		 173 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.72 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.15 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  33.33 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.48 
 
 		 171 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.1 
 
 		 171 aa  84.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  27.46 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.27 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.03 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.54 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 		 171 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  18.94 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  18.94 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.23 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>