99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2267 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 172 aa  333  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  77.46 
 
 		 173 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  66.48 
 
 		 175 aa  230  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  63.22 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  61.63 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  61.05 
 
 		 171 aa  207  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  54.34 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  43.11 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.35 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.37 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.14 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 		 212 aa  87.8  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1649  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1849  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.1 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.79 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.47 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.33 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0476  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0013663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.27 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.09 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  26.21 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.21 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.92 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.23 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.67 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.57 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  27.95 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.36 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.06 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.06 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.63 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.49 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.81 
 
 		 341 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  26.52 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  24.32 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.13 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.88 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  23.78 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.78 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  27.65 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.94 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  25.34 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  29.24 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2125  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.11 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  24.4 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.85 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.02 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0199  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.16 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  26.19 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  26.19 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.07 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.19 
 
 		 364 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  24.07 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.83 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  25.29 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1862  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.68 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.45 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  23.73 
 
 		 275 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.29 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.62 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.02 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  24.71 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2078  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.55 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.88 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.89 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03345  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.98 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1072  OmpH family outer membrane protein  23.75 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1594  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.53 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.75 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.62 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.43 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.22 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.87 
 
 		 184 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.98 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.16 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  33.33 
 
 		 1458 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>